Le Clan Pestilens connut de multiples adversaires au cours des siècles. Il s’agissait tout d’abord des hommes-lézards, puis des skavens eux-mêmes, sans oublier les hommes de l’Empire ou de Bretonnie.

Aujourd’hui, le Clan Pestilens possède encore de nombreux ennemis. Il s’agit principalement, encore et toujours, des Fils des Anciens. La guerre qui les oppose ne s’est, en effet, jamais véritablement terminée et, que ce soit en Lustrie ou dans les Terres du Sud, la lutte continue âprement.

Les moines de la Peste affrontent aussi bien souvent des tribus primitives humaines au plus profond de la jungle, et il leur est même parfois arrivé de se voir confrontés au mystérieux peuple des amazones.

Les serviteurs du Clan rencontrent parfois des bandes de pilleurs de temples, ce qui s’ensuit étant généralement une bataille sanglante et sans merci, que ce soit des elfes noirs, des hommes de l’Empire ou de Bretonnie, et même des barbares nordiques, bien que ceux-ci soient généralement plus nombreux au nord.

Bien évidemment, le Clan Pestilens affronte aussi en nombre d’autres Clans skavens, tentant de s’opposer à son pouvoir ou uniquement dans une optique de mercenariat. Les moines de la Peste sont en effet des êtres avides de combattre pour la plus grande gloire du Dieu Rat, et il est courant de les voir louer leurs services à des Seigneurs de Guerre.